在第二次新吉翁战争、别名‘逆袭的夏亚’终结后，地球圈取得了短暂的和平。这之后3年，宇宙世纪0096年。在工业殖民地“工业7号”上进行了一项秘密交涉。和地球联邦政府有秘密协议，并依此发展的‘毕斯特财团’打算将过去用以威胁联邦的最高机密“拉普拉斯之盒”交给新吉翁的残党军“袖章”。
特别喜欢游戏和金平糖的高中生白柳启，有一天，被一个自称是魅音的神秘女子卷入了战场。 魅音对聚集起来的人们说：“你们已经没有户籍了。” “请成为实验观测器吧。”在场的每人都被给予了特殊的能力参加各种项目。 下定决心要摧毁这一组织的启，以谁都无法预料的能力和罕见的“脑”能力为武器，新时代的头脑派能力战斗开始。
时为公元二二〇五年。是以改变历史为目的的“历史修正主义者”开始对过去实施攻击的时代。被赋予了守护历史这一使命的“审神者”，由他们所唤起的最强付丧神“刀剑男士”。这是，他们以“某个本丸”为舞台，一心一意、开朗明快地生活的“花丸”物语——
自9·11以来，人类社会在堕落和灭亡的道路上高歌猛进。2013年，莫斯科、伦敦、上海、东京等国际大都会接连发生等级超越9·11的恐怖袭击事件，世界局势危在旦夕。圣火在东京一隅的少年岛村乔（宫野真守 饰），其真实身份是编号为009的人造人，他诞生的初衷便是保护世界和平。如今消除了往昔记忆的他再也无法独善其身，经过一系列的波折，终于和当年的伙伴们001伊凡·维斯基（玉川砂记子 配音）、002杰特·林格（小野大辅 配音）、003法兰索娃·阿尔达努（斋藤千和 配音）、004艾柏特·海因利希（大川透 配音）、005索罗门·索尼亚（丹泽晃之 配音）、006张张胡（增冈太郎 配音）、007葛雷特·布林顿（吉野裕行 配音）会面。拥有超人一般能力的他们，面临前所未有的挑战……
濑能名津流（井上麻里奈 配音）只是一个普通的高中生，但是，某一日，被选中的他居然变身成为了女体！并且，一只陪伴在他身边的内脏玩偶切腹虎（野村道子 配音）开口说起了话。切腹虎告诉濑能名津流，他被选中成为了“肯普法”，而作为一名肯普法，他的使命就是与同类“白色肯普法”进行战斗。濑能名津流的生活从此与普通二字再无关联，令他意外的是，他周围的几个可爱女生，居然都是肯普法战士。性格内向，但变身之后就会万分可爱的美嵨红音（堀江由衣 配音）；外表冷酷但实则非常腹黑的三乡雫（名冢佳织 配音）；天真直率，个性有些像男孩子的近堂水岛（阿澄佳奈 配音），在她们的陪伴下，濑能名津流开始了他的战斗。为何要战斗？白色肯普法究竟是谁？这一切的谜团等待着濑能名津流去揭开。
